MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742406

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011734	GGA	2	6	4	9	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011734	TTC	2	6	47	52	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011734	AGT	3	9	54	62	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011734	G	6	6	70	75	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011734	AT	4	8	101	108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011734	TAGT	2	8	155	162	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011734	TCC	2	6	2349	2354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_011734	ATT	2	6	2362	2367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011734	GCTA	2	8	2369	2376	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011734	TAA	2	6	2598	2603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011734	TAT	2	6	2663	2668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011734	T	6	6	2681	2686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011734	TAAT	2	8	2699	2706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011734	A	7	7	2709	2715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011734	T	7	7	2719	2725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011734	ACTT	2	8	2728	2735	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011734	A	6	6	2754	2759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011734	AAAG	2	8	2761	2768	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011734	TAA	2	6	2886	2891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011734	TCT	2	6	2906	2911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011734	AGA	2	6	2934	2939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011734	TAT	2	6	4254	4259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011734	A	8	8	4269	4276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011734	CTA	2	6	4294	4299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011734	TAAA	2	8	4325	4332	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011734	A	6	6	7412	7417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011734	AAT	2	6	7422	7427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011734	ATT	2	6	7483	7488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011734	GGC	2	6	7497	7502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011734	CCG	2	6	7504	7509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_011734	CCAAG	2	10	7516	7525	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_011734	ATT	2	6	7679	7684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011734	CT	3	6	7770	7775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011734	ATGG	2	8	7778	7785	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011734	TAAA	2	8	7810	7817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011734	ATC	2	6	10043	10048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011734	TTTC	2	8	10052	10059	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011734	G	6	6	10073	10078	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011734	AAC	2	6	10127	10132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011734	GAA	2	6	10138	10143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011734	G	6	6	10148	10153	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011734	G	6	6	10187	10192	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011734	TTA	2	6	10239	10244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011734	TAAC	2	8	11598	11605	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011734	A	6	6	11618	11623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011734	TAT	2	6	11664	11669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011734	ATAAA	2	10	11713	11722	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011734	TG	3	6	11893	11898	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011734	CA	3	6	11910	11915	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011734	AG	3	6	12113	12118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011734	ATA	2	6	12173	12178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011734	CT	3	6	12191	12196	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011734	TGT	2	6	12202	12207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011734	CTC	2	6	12234	12239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_011734	AGA	2	6	12355	12360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011734	ATAA	2	8	12404	12411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011734	A	9	9	13215	13223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011734	TAC	2	6	13299	13304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011734	ACCC	2	8	13334	13341	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
60	NC_011734	CGC	2	6	13353	13358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_011734	TCA	2	6	13394	13399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011734	CAA	2	6	13420	13425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011734	CTG	3	9	13495	13503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011734	AAG	2	6	13511	13516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011734	TCG	2	6	13589	13594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011734	CT	4	8	13728	13735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_011734	A	6	6	13795	13800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011734	AGAC	2	8	14089	14096	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011734	CAA	2	6	14130	14135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011734	CTT	2	6	14997	15002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011734	AGAA	2	8	15034	15041	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011734	TC	3	6	15084	15089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011734	AGA	2	6	15101	15106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011734	TAA	2	6	15153	15158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011734	TCA	2	6	15174	15179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.